Muzeum posiada bogate zbiory kopalin użytecznych, pochodzących z całego świata, a także kolekcję minerałów skał i skamielin, występujących w skorupie ziemskiej. Najstarszą kolekcją muzealną są okazy skał, minerałów i rud, zebrane przez ks. Leona Szersznika, pochodzące z XVIII i XIX w. Warto również wspomnieć, iż cześć zbiorów paleontologicznych została przekazana z gliwickiego muzeum zaraz po II wojnie światowej. Ze względu na rolę w kulturze materialnej człowieka na uwag zasługuje kolekcja narzędzi krzemiennych, znajdowanych w zamieszkałych przez człowieka pierwotnego grotach - od najstarszych - pięściaków (epoka kamienia łupanego) do ostrzy i rylców (epoka kamienia gładzonego). Do obiektów, na które warto zwrócić uwagę, należą też meteoryty.
Godna obejrzenia, z uwagi na swoiste piękno, sposób wykształcenia, barwę, przeźroczystość, połysk i blask jest kolekcja druz kryształów: kwarcu, ametystu, fluorytu, gipsu, kalcytu, soli oraz kamieni półszlachetnych i dekoracyjnych: agatów (w tym słynne okazy z Brazylii), jaspisów, obsydianu, malachitu, azurytu i innych.
